1999保密协议，通俗来讲，就是“签了协议的人绝口不提1999年那场仗”。它是虚构集体创作“1999战记”的核心设定之一，类似《黑衣人》里记忆消除器的网络版。‌‌
1999战记，是当年全网网友联手脑补出的“史诗级同人宇宙”。传说在1999年，人类和撒比星人（据说是长得像蟑螂的触手怪，战斗力堪比赛亚人）爆发了一场跨星系大战。人类惨胜后，用类似《X档案》的“绝密级洗脑术”抹去了所有非战斗人员的记忆。参战的老兵虽然记忆保留，但得签署一份比《星际迷航》里的最高指导原则还严格的保密协议，从此闭口不提。战后，没上过战场的人都被植入了“那年不过是个普通年份”的假象。

这个梗的起源，要追溯到2013年3月6日14时12分的一条微博。那天，某个“时光穿越者”发帖说：“1999战记：80后90后当年如何拯救世界？”文中赫然写着：“00后的小弟弟小妹妹们，你们真的以为80后90后没你们强吗？你们本来不该出生的，是我们80后90后在1999年拯救了这个世界，你们才得以出生。甭查，网上可没有。那天晚上我们大战外星人、抵抗陨石（顺便一提，陨石其实是撒比星人的母舰）的时候，还抹去了所有人的记忆。孩子们啊，为你们的出生而感激我们吧→_→”

就这么一条微博，像《盗梦空间》里的图腾一样，瞬间勾起了广大网友“被封印的记忆”。大家纷纷点头：“对对对，那年我还在用诺基亚打外星人！”1999年那个拯救世界的悲壮故事，就这么在评论区里“实锤”了。

最初，这个设定是为了方便创作者圆谎——解释“星球级别的战争只有我一个人知情”这种类似《楚门的世界》的逻辑漏洞。但后来，玩梗的人越来越多，只要有人提起“1999战记”，评论区就会自动复制粘贴：“别说了，忘了保密协议吗？你想被黑衣人请喝茶吗？”搞得神神秘秘，跟《E.T.》里的政府封口令似的。不了解真相的新人常常被一脸严肃地带节奏，以为1999年真有过什么不为人知的星际大战。
（尤其适合拿来忽悠00后，效果堪比说“奥特曼是真实存在的”）